磁碟搜尋是效能的巨大瓶頸。當資料量開始變得非常大，以致於無法進行有效的快取時，這個問題會變得更加明顯。對於您或多或少隨機存取資料的大型資料庫，您可以確定您至少需要一次磁碟搜尋才能讀取，以及幾次磁碟搜尋才能寫入。為了將此問題降至最低，請使用搜尋時間較短的磁碟。

透過將檔案符號連結至不同的磁碟或條帶化磁碟，增加可用的磁碟主軸數量 (並藉此減少搜尋額外負荷)

為了可靠性，您可能想要使用 RAID 0+1 (條帶化加上鏡像)，但在這種情況下，您需要 2 × N 個磁碟機才能保存 N 個磁碟機的資料。如果您有錢，這可能是最佳選擇。但是，您可能還必須投資一些磁碟區管理軟體才能有效處理它。

一個好的選項是根據資料類型的關鍵程度來調整 RAID 等級。例如，將可以重新產生的半重要資料儲存在 RAID 0 磁碟上，但將真正重要的資料 (例如主機資訊和日誌) 儲存在 RAID 0+1 或 RAID N 磁碟上。如果您有許多寫入，RAID N 可能會是一個問題，因為更新同位元位元需要時間。

您也可以設定資料庫使用的檔案系統的參數

如果您不需要知道上次存取檔案的時間 (這在資料庫伺服器上不是很有用)，您可以使用 -o noatime 選項來掛載您的檔案系統。這會略過對檔案系統上 inode 中上次存取時間的更新，從而避免一些磁碟搜尋。

在許多作業系統中，您可以透過掛載時使用 -o async 選項，將檔案系統設定為非同步更新。如果您的電腦相當穩定，這應該可以在不犧牲太多可靠性的情況下，提供更好的效能。（此標誌在 Linux 上預設為開啟。）