索引快取可以隨時透過更新其參數值來重組。例如

mysql> SET GLOBAL cold_cache.key_buffer_size=4*1024*1024;

如果您將 key_buffer_size 或 key_cache_block_size 索引快取元件指定為與元件目前值不同的值，伺服器會銷毀快取的舊結構，並根據新值建立新的結構。如果快取包含任何已變更的區塊，伺服器會在銷毀並重新建立快取之前將它們儲存到磁碟。如果您變更其他索引快取參數，則不會發生重組。

重組索引快取時，伺服器會先將任何已變更的緩衝區內容刷新到磁碟。之後，快取內容將變得無法使用。但是，重組不會封鎖需要使用指派給快取的索引的查詢。相反地，伺服器會使用原生檔案系統快取直接存取資料表索引。檔案系統快取不如使用索引快取有效率，因此雖然查詢會執行，但可以預期會變慢。重組快取後，它會再次可用於快取指派給它的索引，並且索引使用檔案系統快取的情況會停止。